自然繁殖是传统的金鱼繁殖方法，既适用于大面积的金鱼场，也宜于家庭式小缸池金鱼繁殖。
秋去春来，天气逐渐转暖，水温也不断升高，金鱼由冬水转入温暖的新水后，十分活跃，上下游动，喜戏玩耍。此时，经过一冬发育的适龄金鱼的性细胞已经成熟，在清盈的水中，常可见到一双双、一对对的“情侣”，形影不离地漫游上下。
当雌鱼性腺兴奋时，受生理刺激，分泌出一种激素诱引雄鱼，然后”羞答答”地沿池边急游，雄鱼嗅其味后紧紧尾随不舍，有时几条雄鱼在旁助威，可出现成群结队的雄鱼浩浩荡荡地追逐一尾雌鱼，并激起朵朵水花的情景。其中首当其冲的雄鱼往往迅速用自己的头部撞击雌鱼的尾部肛门处，刺激雌鱼进一步兴奋，雄鱼追逐1～2小时后，雌鱼力乏，减缓游速，而雄鱼则凭借其强健的体魄继续追逐，并把雌鱼“推”向草际。
在水草丛中，雄鱼用鳃盖和胸鳍上的“追星”猛擦雌鱼的腹部，使雌鱼兴奋地来回穿梭。随着尾部的剧烈摆动和体腹肌的协调收缩，透明的浅黄色卵珠即相继由生殖孔中排出，均匀地散布于水草上。与此同时，雄鱼也从生殖孔中排出乳白色精液。雌鱼排出的卵珠中央有一个向内凹陷的微孔，俗称“精孔”，当快速游动的精子遇到卵珠后，即迅速钻入，精孔关闭，卵珠即受精。
受精的卵珠在水中微微膨胀，然后进入胚胎发育期。而未受精的卵珠和精液便会迅速灭亡，腐败分解，易败坏水质，对金鱼不利。
外界因素对产卵的影响
性腺成熟的金鱼，其繁殖活动对外界环境具有一定的要求。现分述如下：
金鱼属变温动物，对温度的变化十分敏感，金鱼进入性成熟期的快慢，与外界因素如温度、气压、光照、水质有着千丝万缕的联系。其发育必须在适温下才能良好地进行。秋末，金鱼的性腺发育通常可达第4期，入冬后，气温下降，其性腺发育逐渐缓慢，甚至停滞。待春风送暖之季再迅速发育。15℃～20℃的水温，通常能促发金鱼的旺盛性欲。若气温突变，金鱼的繁殖活动即会暂缓进行。在高于30℃低于5℃的池水中，雄鱼一般停止排精，雌鱼停止产卵，即使偶尔出现排精或产卵现象，其鱼卵的受精率也极其低下。
正常的气压是金鱼繁殖活动的主要保证。气压低下，鱼感不适，反应强烈。尤其是闷热的条件下，金鱼几乎停止排精或产卵活动。
光照对生物体的新陈代谢具有积极的作用。适当的光照能加速金鱼脑下垂体的激素分泌，促进雌雄鱼体的性腺兴奋。在黎明和晴朗温暖的白昼，金鱼的繁殖活动较为频繁，而在强光和黑暗环境下几乎停止。
水族箱内的污物和氧气可直接影响金鱼的性腺发育和生殖能力。通常，清澈透明的清水溶氧较高，能促进金鱼的性欲旺盛。减少污物及藻类对精虫活动的阻碍，有利于鱼卵的受精。含藻类较多的绿水，尽管含氧量较高，但缺乏新水所特有的刺激性，一般多用于稳定金鱼的性欲，延缓产卵期，或护理产后金鱼。
产卵前后的雌雄金鱼，对水质尤为敏感，若水中缺氧或pH值不适，亲鱼的繁殖活动就显著衰退，呼吸缓慢，疲劳不堪，这不仅影响金鱼的正常繁殖活动，甚至危及亲鱼的生命安全。
产卵的一般规律
金鱼的自然繁殖是有一定规律可循的，每年的阳春3月，气候温暖，清晨水温通常达15℃～20℃，这对性腺基本成熟的金鱼极为有利。在新水的刺激下，金鱼的脑垂体加强分泌，至次日黎明或上午10时前，即可出现雌雄金鱼相互追逐，以及排精、产卵的情景。
而到了春末夏初之时，即5～6月份，由于气温逐渐升高，金鱼的繁殖活动也随之趋于低潮，集中于黎明前后，中午水温较高，金鱼一般多躲于阴影处，很少活动。7月初，金鱼的繁殖活动进入尾声。排卵稀疏，大多集中于水温较低的半夜及黎明。也有个别性欲特旺盛的亲鱼，其繁殖活动一直可持续到初秋之时。
雌鱼卵巢内的生殖细胞并不是一次发育成熟的，它们成熟一批，排一批，其间隔期约1～2周。成熟的雌金鱼，在整个繁殖期可先后排卵3～5次，产卵量少则数千，多则上万。雄鱼也可多次排精。
