如果要看金鱼的性别，较为可靠的方法是观察它腹部的特征，把金鱼翻过来看，您可以看到位于肛门前方的生殖乳突，雄鱼的生殖乳突既尖又细，而雌鱼的则是大而圆。这是最正确的辨别方法，不过通常还有粗浅的辨视法，就是以外形来判断，同一品种金鱼，雄鱼的腹部一般都比雌鱼小，而雄鱼的体色反倒比雌鱼艳丽许多，另外雄鱼的鳍条也比雌鱼长。
金鱼有一定的生育周期，通常环境因素会透过内分泌而支配到金鱼生殖腺的发育，而对中国而言，春天就是金鱼主要的繁殖期，因为当春天来临，白天日照时间渐长，金鱼的脑下垂体会分泌一种刺激生殖腺的激素，使得雌鱼的卵日渐成熟，雄鱼的精子也相继活跃起来。生殖腺产生激素刺激鱼体，使得鱼体出现了第二性征，而这第二性征就是辨别雄雌鱼最好的方法。例如：雄鱼在繁殖期会出现追星，而雌鱼没有。
雄鱼的追星是易于辩认的第二性征，在它鳃盖和胸鳍的第一条鳍条上出现许多一颗颗的小白粒，有时连眼部周围和鳍盖后面的鳞片也会出现追星。当您用手捕捞雄鱼时，会明显地感觉到它那粗糙感的追星，如果追星出现越多，它会越发疯狂地追逐准备产卵的雌鱼。
从外形看，繁殖期的雌鱼其腹部胀大，而且更浑圆。另外一种方法是用力沿金鱼腹部向后磨擦，如果流出的是白色的液体，就是雄鱼，反过来说，如果排出一串串淡黄色的卵，那肯定就是雌鱼。
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雌鱼性征表现：体形粗短；胸鳍条较细软，鳍的自由端较钝圆；腹部膨大而浑圆；肛门前缘的鳞片松弛而软；发情期肛门红肿；因腹中蕴藏卵粒而较重，游泳缓慢。
雄鱼性征表现：体形较细长；胸鳍条较粗硬、鳍的自由端较尖；腹部较狭窄而扁；发情期肛门不红肿；肛门前缘鳞片紧贴而发硬；发情期胸鳍的前缘和鳃盖边缘有白点（追星）；发情期游泳迅速，有追逐雌鱼的行为。
